يعتبر رئيس الملائكة ميخائيل شفيعًا وحارسًا للرهبان لذلك يوجد في أعلى كل حصن دير، كنيسة صغيرة على أسم الملاك، ولم يخرج حصن دير السريان بوادي النطرون عن هذا التقليد.
ويوجد الحصن على يمين الباب الأثرى للدير من الجهه الغربية وهو حصن عالى كان يلجأ إليه الرهبان لإتقاء غارات البربر وغيرهم.
ويبلغ إرتفاعه ١٨ مترًا وطوله ١٤ مترًا وعرضه ١٣ مترًا يتكون من ٤ طوابق يفتح بابه فى الطابق الثانى ويتم الوصول إليه بقنطره من الخشب السميك والتى ترتكز على باب الحصن وبناء مقابله ترفع هذه القنطرة عند اللزوم بسلاسل مثبته من خلفها وله باب سميك فلا يستطيع أحد ما أن يصل الحصن بعد رفع القنطرة وكل طابق به حجرات واسعة.